事实上，明孝陵只有两次面临被盗掘的危险，一次是太平天国，另外一次是日本侵华后南京沦陷。
朱元璋从即位后，就开始为自己修建陵寝，前后用了25年的时间，长年在施工现场的军民有10万人，大家可以想象其工程的浩大。经过先进仪器探测，明孝陵的地宫面积4000多平方米，足足是万历定陵地宫面积的三倍。
而且明孝陵也采取了多种防盗手段。
别人的陵墓是从地面向下挖掘，朱元璋的陵墓是把独龙阜这座石头山中间挖空了，也就是说陵墓周围全是石头。
陵墓上方又铺上了厚厚的雨花石，只要有人挖洞，雨花石就会把洞自动填满。
一般皇陵的地宫墓道都是笔直的，朱元璋陵墓的墓道是弯曲的，而且还一反常规的偏离了陵寝的中轴线，这样即便有人挖穿了石山，也找不到墓道所在。
防范措施如此强悍，一般的盗墓贼只能望山兴叹了！能对明孝陵产生威胁的，也只有孙殿英之类的手下有成规模大部队的人。
明朝开国太祖的陵寝自然是百般防护，不会出现丝毫的疏忽。满清入关后，为了收汉人之心，也是对明孝陵礼敬有加，康熙和乾隆两代帝王都曾数次拜谒，假惺惺的收买人心。民国革命曾有“驱除鞑虏，恢复中华”的口号，原本就是脱胎于朱元璋的当年驱除蒙元的口号，民国政府毕竟不是土匪，绝不会挖了朱元璋的坟。
历史上，明孝陵建成后，只有两个时期，被盗风险比较大。一个是太平天国事情，另外一个就是日军侵占南京之时。
太平天国定都南京后，据说有两个和明孝陵相关的举动，一个是太平军砸了明孝陵的地上建筑物，另一个是洪秀全参拜明孝陵。我认为太平军没有动朱元璋的陵墓，很可能有以下几个原因，一是技术不行挖不动，二是要保持形象，争取汉族人民的支持，三是一直忙着内斗和防御清军，没时间挖坟掘墓。总之，明孝陵躲过了洪秀全的荼毒。
再说日军侵占南京时期。史料上一直没有日军挖局皇陵的记录，北京的明清两代帝王陵墓也没有被日军挖掘。我分析也有两个个原因。首先还是惺惺作态收买人心。要知道，日本可是打算在中国安家的，挖坟掘墓的事尽量不做为好，其次，南京汪伪政权成立，毕竟还要给几分面子。
无论如何，明孝陵经历了600多年的风雨，地下建筑依然完好无损，这不仅是朱元璋的幸运，更给我们留下了宝贵的文化财富，是件幸事！
盗墓贼不敢盗朱元璋墓，主要基于三个方面的原因。
一、盗墓贼在时间上没有下手的机会
朱元璋作为明朝的开国皇帝，在整个明朝，盗墓贼想要盗掘皇陵根本没有可能。清兵入关后，清政府为了宠络民心，不仅没有损毁朱元璋墓，还对其进行保护，这一时期盗墓贼也没有机会。
而洪秀全、孙中山在南京建立政权后，朱元璋墓仍旧被保护起来。老蒋时期，南京又成了民国政府的政治、经济和文化中心，盗墓贼同样无法下手。
二、盗墓贼未能掌握和确定朱元璋墓的真实地点
朱元璋出殡时，为了迷惑盗墓贼，除了广为流传的 “十三城门出棺材”，民间一直流传朱元璋的墓可能在三个地点。一是明孝陵，二是朝天宫，三是中山门外前湖。
明孝陵所处的位置原是开善寺，朱元璋看到巍巍钟山云雾缥缈，紫气上升，气象万千。而开善寺地处钟山的独龙埠、玩珠峰，气势雄伟， “ 独龙玩珠”符合帝王真龙天子象征。而且玩珠峰北依主峰，就象一座天然巨大陵寝。因此，朱元璋下旨迁移开善寺，在这里建造陵墓。朱元璋入葬后，为了守卫明孝陵，按明朝军制设 立 “ 孝陵卫 ”，驻守军队多达万人。
朝天宫是金陵宝地。吴王夫差在朝天宫建立了冶城，据说朱元璋决定秘密安葬在朝天宫古井下，是想借古今之瑞气，又能防止后世盗墓。
中山门外前湖，原是燕雀湖的一部分。燕雀湖绝大部分填实后，修建了皇宫。剩下前湖和皇宫一道城墙之隔。因朱元璋留念皇宫，死后就葬在中山门前湖水下。
三、盗掘朱元璋墓要投入巨大的人力、物力、财力
以明孝陵为例，从洪武十四年开始营建，由中军都督府佥事李新主管，征集十万人历时三载才告竣工。以这样的规模，不投入巨大的人力、物力和财力根本不行。而中山门外前湖要求水下作业，朝天宫则在古井下，其难度同样不低。
因此，不仅盗墓贼不敢盗取朱元璋墓，诸多的因素也制约了盗墓贼，让其不敢轻举妄动。
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