这四个词差别还是挺大的，不知道题主主要是哪方面不清楚。
可以简单地先对应英语来看：être相当于英语中的 be动词，主要是表示“是”，例如Je suis étudiante.(我是学生。)；avoir是“有”，例如 J’ai une sœur.（我有一个妹妹。）在英语中相当于“have”；aller表示“去……”，Je vais à la biliothèque. （我去图书馆。））简单来看可以相当于英语中的“go”；“fait”是动词“faire”的变位，原型faire表示“做”，相当于英语中的“do”。这个应用范围就很广了，“J’aime bien faire la cuisine. （我喜欢做饭。）”
当然，这些都是法语中很常用的动词，不只有一个意思，这个需要多查词典，记住平时多件的表达，在句子和文章中去领会单词的用法。
此外，法语和英语之间一直存在着紧密的联系，由于英法两国的地理近邻关系以及联姻、，贸易、战争等其他因素，法语和英语在发展中一直在互相影响着。英语作为世界上词汇量最大最丰富的语言，主要是因为它接纳和吸收了很多外来词汇，其中直接或间接来自法语的词汇占了26.4%。可见这两种语言的关系之密切，因此，学习法语久了，自然可以看到很多“长”的和英语单词很像的词汇，因此对于初学者来说，可以多对比英语来学习法语，更清楚、更简洁地体会单词和句子的构成及意义。
更简单也是更重要的是，对于初学者来说，看到不懂的就可以多查词典，多看看例句或短语的构成，在句子中理解单词。当然，如果可以的话，推荐多看法法解释，坚持下来想必会有不小的进步。
题主在问“它们到底有什么区别”了，想必是发现了它们有共同点了。我想应该要先了解题主发现的共同点，才比较好告诉你到底有什么区别～
我猜，题主是发现它们都可以做“助动词”才有。
Être 和avoir 都可以做复合时态里面的助动词，不同的是être 做助动词只能是几个特殊的动词，比如来去、生死等。而其它动词用做复合时态时用avoir。
Je suis allé à Pékin hier.我昨天去了北京。
Il a chanté.他唱了歌。
aller也可以做助动词，但用于最近将来时或者过去最近将来时。
Je vais aller à Pékin.我将去北京。（第一个aller是助动词）
faire并不算是严格意义上的助动词，而是个万能动词，有个结构是faire faire...第一个faire是真正的faire，第二个其实是指代动词。
Je lui fait chanter.我让他唱歌。
希望我的脑回路和你的对接成功了～～
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