纵观中国历史上“邪教 ”，有的是披着“正教”的外衣反抗当局，有的是乱世之下蛊惑人心，更多的是在自我膨胀的过程中旁逸斜出、偏离初衷……历史上出现过的邪教数不胜数，两汉的偏本土化，魏晋的偏异域性，唐宋繁盛，元明异变，清代则是集大成者的错乱期，不光是统治者，连邪教本身都搞不清自己渊源何处了。
宋元时期政治家耶律楚材曾有过一段著名的“邪正之辩”：“夫杨朱、墨翟、田骈、许行之术，孔氏之邪也；西域九十六种、此方毗卢、糠、瓢、白莲、香会之徒，释氏之邪也；全真、大道、混元、太一、三张左道之术，老氏之邪也”。按耶律楚材的观点，邪教的定义相对简单，只要与儒、释、道三家正统相异，就可以标榜“邪教”了。这种鉴定不失为一个明确的分类，我们不妨从这个角度，来清点一下中国历史上的一些较为“突出”的邪教。
首先，儒家是否具有宗教性，这一点存在争议；我们通常也倾向于将世俗色彩浓厚的儒学当作中国古代的统治理念来对待，因此暂且不作讨论。
道教是中国的本土宗教，成形于两汉时期。 东汉末年，烽火连天，苦难的土壤孕育出南北两大支民间道教——张陵在巴蜀创立的五斗米道和张角在华北创立的太平道。
五斗米道，顾名思义，入教时需要交纳五斗米的“会费”。只信奉太上老君与张陵自号的“三天之师”， 宣扬符水能治病，有自己一套除罪治病的体系。这迎合了许多寻常百姓的日常需求。在张鲁割据汉中之时，实行以五斗米道为基础的政教合一体制，因而形成了一个强大的宗教王国。
这种抱团势力自然不能被正统权力所容纳，五斗米道一直被视为异端邪说，被污称为“米贼”、“淫妄”，在建安二十年间遭到曹魏的征讨。这反而促进了五斗米道传向中原、流布四方，随后利用五斗米道的起义多不胜数，以孙恩、卢循起义的破坏性为最。
太平道的创办人是钜鹿的张角，自称为“太贤良师”，也是主打符水咒说以治病，本着“致太平”的初衷教化天下、广纳信徒。 随着组织的膨胀，张角逐渐萌发了改朝换代之心。以神之旨意为号召，发动黄巾起义。那句“苍天将死，黄天当立”，就是这场起义的口号。天下相应，京师震动，这场残酷的攻伐随着张角的病死而草草收场，却在随后的二十多年，接连不断地出现了一波又一波的神道起义，海内鼎沸，百姓流离。
后面又有东晋葛洪创建的方仙道，北魏的寇谦改造五斗米道，金代的王重阳建立全真道教，还有混元、大道、太一等等。这些道教的变体在历史上或多或少都都曾遭到禁止，严重一点就被奉为“妖道”。但是，许多派别都曾做过正统化的努力，就比如《神雕侠侣》中率先出场的丘处机，为全真教的“七真”之一，曾两次受到金世宗的接见，至金太祖时，全真教竟由民间转变为正统，在元朝盛极一时。
在中国民间宗教的发展过程中，佛教的影响举足轻重，其世俗化的教派或者异端邪教遍布各朝各代。打从南北朝时期，沙门举旗造反称王的事件频频出现，仅北魏孝文帝在位期间就先后有法秀、司马惠等人分别发动的五次沙门反动事件，影响恶劣，让统治者不得不将其视为洪水猛兽，并将其背后世俗化的观音、弥勒信仰打入邪教范畴 。
有一名叫做法庆的反动者，引领大乘教教徒参与暴动，称“杀一人者为一住菩萨 ”。这种怪异的说法显然违背了佛教本身的教义，但受其蛊惑的教徒却不管不顾，屠灭法舍，斩戮僧尼，还说新佛出世，除去旧魔。这荒诞不经的教义宗旨还颇有些《风云2》的玄幻色彩。事件当然是以失败告终，但造成影响相当惨烈，社会震动，随之而来的是上层更加严酷的禁令。
最为人所熟知的释门邪教，当是发端于南宋初年的白莲教了。白莲教，可以理解为一群奉行净土法门的男男女女于忏堂中共修净业。
起初，白莲教具有结社参佛的性质，教义通俗，图文结合，放宽了对男女、出家与否的要求，因而也成就了该教在民间的兴旺发达。一直到元初，多数白莲教团依忏堂而存在，念经垒忏，安分守法；但到了元末，情况发生了转变，部分白莲教团及其香会在元末农民运动中发挥了主导作用，像彰德的朱帧宝、柳州的高仙道、河南远安县无量寺僧人，等等。
最终，白莲教把自己从一个纯洁的修行教团，作成了被禁断的“邪教”，“禁白莲社，毁其饲宇，以其人还民籍”。至于明清时期的“白莲教”，已被各大门派玩坏，不光本教派的教义宗旨偏离初衷，而且还与其他释门民间宗教相混杂，甚至别的教派发动起义也把脏水泼在白莲教身上……变异株连，已不是白莲教的本来面目了。清朝统治者干脆把白莲教等一干吃斋的非法宗教，统称为“斋教”或“斋匪”。
除了释门、老氏之邪，还有金庸笔下的“明教”。明教又称摩尼教，隋唐时期传入中国。译师在翻译经书时常常比附佛教中的概念，常致时人混淆。可能也是因为这个原因，被佛、道正派群起而攻之，斥之为异端，“魔教”的称呼也由此而出。
唐武宗灭佛时，摩尼教同遭到禁断，摩尼师与寺院得到严厉的处置。自此，摩尼教转为地下发展，官府始终难以将其铲除干净。相传，宋真宗时，摩尼教人士还通过贿赂的方式，将其自家经义编入了《道藏》，作为正统宗教教科书留存下来。
随着势力的扩张，明教的教团势力引起了当局的恐慌 ，元代已下达了严办明教的敕令，但明教的风头日盛，成为起义军的一种组织形式。它与弥勒教、白莲教融为一体，公开以“弥勒降生，明王出世”为口号，成为了元末红巾军起义的一股强大的力量。改天换地之后，以此上位的朱元璋深刻地认识到这种民间宗教的重大威胁，紧接着就扑灭了明教之火，还下诏禁止其他宗教。于是乎，千万个等待着被改变命运的民众，又成为了“斋教”的棋子，开始新一轮的运作。
中国古代的邪教还有很多，就不一一列举了。
何以邪教？在乱世中给人以慰藉的是它们，在变局中视人命为草芥的也是它们。邪教的妖风刮了数千年，受苦受难的始终都是那些满怀希望却又挣扎活着的升斗小民罢了。
参考文献：
马西沙、韩秉方，《中国民间宗教史》
高票回答已经罗列了许多了，但是我想补充几点。
首先，我们要看怎么下这个邪教的定义。如果是占在今天的角度来说，很多古代的邪教他就不算邪教，什么白莲教，明教，他就是贫民百姓为主的结社自保，是一种生产互助和精神安慰。如果占在古代统治阶级的角度来说，你们这些老百姓，不感谢我的鸿恩，居然不老老实实的吃土等死，居然敢反抗，你不是邪教谁是邪教。所以占的的立场不同，那么对于邪教的定义不一样。
其次，无论是当今社会还是古代社会，那些以宗教为名，行残害生灵之事，比如什么祭奠童男童女啊，什么双修啊，组织大屠杀啊，残害百姓啊，也就是反社会反人类反道德，这样的才是真正的邪教。
大家按照这个定义再来对照以上的高赞答案，自然能够得出那些是真正的邪教。邪教邪教，重在一个邪字。
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